Application of next-generation sequencing to characterize novel mutations in clarithromycin-susceptible Helicobacter pylori strains with A2143G of 23S rRNA gene

Table 2 SNVs of the 23S rRNA outside of 2143

Nucleotide position	Ref	Mutation	S1	S2	S3	S4	S5	S6	S7	S8	S9	S10	S11	S12
973	G	T	+	−	−	+	−	−	−	−	−	+	−	−
973	G	A	−	−	−	−	+	−	−	−	+	−	−	−
973	G	C	−	+	+	−	−	+	−	+	−	−	+	−
1023	G	A	+	−	+	−	−	−	−	−	+	−	−	−
1279	A	T	−	−	−	−	−	−	+	−	−	−	−	−
1280	A	G	−	−	−	−	−	−	+	−	−	−	−	−
1314	G	A	+	−	−	−	+	−	−	+	−	−	−	−
1513	G	A	+	+	−	−	−	−	+	−	+	−	−	−
2173	C	T	+	−	−	−	+	−	−	+	−	−	−	−
2182	T	C	+	+	+	+	+	+	−	+	+	+	+	+
2302	A	G	+	−	−	−	−	−	−	−	−	−	+	−
2485	T	C	−	−	−	−	+	−	−	−	−	−	−	+
2143	A	G	+	+	+	+	+	−	−	+	−	−	+	+

S2 and S3 (italic values) indicates the phenotype-susceptible strains with mutant in A2143G of 23S rRNA gene
+ Represented that the mutation had been detected and − represented the mutation had not been detected

ISSN: 1476-0711